先说废话：在导师办公室2天+自己在家一天终于完成了caffe的配置，（上一篇随笔说好每天更新blog没有做到但我真的有在忙= =）整个过程掉坑无数，还好lucky enough配置完毕，趁着在跑cifar-10的train_full的时间整理一下整个流程，等导师的titanx到了以后还要再配置一次。
env:Alienware17-R3,Ubuntu16.04 64-bit,NVIDIA Geforce GTX 980m (导师科研经费买的titanx没到，我的外星人只好先充公了，哈哈）
配置了CUDA8.0,cuDNN5.0,opencv2.4.13
参考了一些内网和外网的资料，我会尽量全部自己写，实在遇到需要参考的内容会贴出网址。
首先你得有一些基本的linux基础，哪怕你在macOS上玩过terminal也可以，毕竟都是unix-based。
稍微提一下自行安装ubuntu16.04的流程：去ubuntu官网下一个镜像文件，用u盘自制系统盘，然后照着装就行，具体请看http://www.linuxidc.com/Linux/2016-04/130520.htm。
首先先打开terminal,输入以下dependencies:
1 sudo apt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libhdf5-serial-dev protobuf-compiler 2 sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev 3 sudo apt-get install libopenblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev 4 sudo apt-get install libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev
I. Nvidia 驱动
ubuntu装好以后需要安装nvidia驱动，ubuntu默认驱动识别了intel的显卡肯定是不行的，这里请上nvidia官网http://www.nvidia.com/Download/index.aspx?lang=en-us查询你需要什么驱动，现在2017年1月30日基本上标配是375，但是还是查一下比较稳妥
安装方法网上有很多说法，有说要blacklist这个那个，要关闭xserver，lightdm之类的。我在这里花了两天时间，以上方法均造成了各种问题。最终我安装成功的方法是
1. Runsudo apt-get purge nvidia-*
2. Runsudo add-apt-repository ppa:graphics-drivers/ppaand thensudo apt-get update
3. Runsudo apt-get install nvidia-375
4. Run sudo reboot
这里是一个非常tricky的点，我时间主要花在这里了，查了非常多资料，之前各种当机原因我只搞清了其中几个，这里稍微整理一下：
1. 用ubuntu里设置自带的additional drivers选择nvidia driver，失败，无法完全安装
2. blacklist了nouveau，使用alt+ctrl+f1，sudo service lightdm stop(关闭xserver），apt-get 手动下载的安装包，一样当机
3. 安装cuda8.0时第一个选项“是否安装nvidia驱动“选择了yes。。。这里一定要选择no。。虽然他default是yes,但是后来发现caffe官网上已经明确说因为cuda绑定的nvidia driver版本usually out-of-date所以要跳过这一步。。
只能说如果有特殊情况问题请留言，我会尽量帮你解决。博客我天天看，回复不会超过24小时
有两个方法check是否安装完成，一是输入sudo nvidia-smi，如果正确显示显卡信息则为安装成功
二是直接右上角查看this computer,显卡显示的是不是n卡就行
II. cuda8.0
当你的ubuntu能正确识别nvidia显卡以后我们就可以开始安装cuda了（其实有资料说顺序随意，不过反正我是按这个顺序配置成功的，就这样写了）。
首先去cuda官网下载cuda8.0https://developer.nvidia.com/cuda-downloads
一步步选择linux->x86_64->ubuntu->16.04->runfile(这里选择runfile是为了能跳过cuda自带的n卡驱动安装），然后就可以下载了，1.4个g，你可以趁现在喝杯茶。
下载好以后cd到你下载的地方，run"sudo shcuda_8.0.44_linux.run"，具体文件名自己check，一开始会有很多要读的霸王条款，直接q到最后，输入accept。后面会让你选择各种细节安装项，这里注意问你是否要安装nvidia driver一定要选择no,我安装的时候是第一个。
安装好以后sudogedit ~/.bashrc ，将下面内容写到bashrc最后
export PATH=/usr/local/cuda-8.0/bin${PATH:+:${PATH}}
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda8.0/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}
然后测试一下cuda给的sample:
cd /usr/local/cuda-8.0/samples/1_Utilities/deviceQuery
make
sudo ./deviceQuery
如果显示了你的GPU相关信息，说明安装成功
III. cuDNN
这里我cuDNN使用的是5.0版本for CUDA8.0.，在https://developer.nvidia.com/rdp/cudnn-download下载，需要先注册一个账号。选择cuDNN v5 Library for Linux.
下载好以后解压sudo tar -zxvf ./文件名
然后
$ cd folder/extracted/contents
$ sudo cp -P include/cudnn.h /usr/include
$ sudo cp -P lib64/libcudnn* /usr/lib/x86_64-linux-gnu/
$ sudo chmod a+r /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcudnn*
IV. opencv
这里选择的版本是2.4.13。3.0，3.1均会出现一些兼容问题，所以选择了2016年release的2.4.13版本
http://opencv.org/downloads.html 这里下载
下载好以后
unzip opencv-2.4.13.zip 具体文件名自己看，会有出入
将其复制到准备安装的目录下，这里assume文件夹名为opencv
cd ~/opencv
mkdir build
cd build
sudo apt install cmake
sudo cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=Release -D
CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local ..
sudo make
我的2.4版本直接配置完毕，如果是3.0和3.1可能会出现兼容问题，具体看个人选择自行查阅资料解决，这里我没装3.0
compile完以后
sudo make install
完成安装
V. caffe!
前戏这么多终于进入正题开始配置caffe了。。
从github上下载caffe: git clone https://github.com/BVLC/caffe.git
如果没有安装git，需要先: sudo apt-get install git
然后sudo cp Makefile.config.example Makefile.config
打开Makefile.config文件，这里需要权限不要忘了sudo。用getit或者nano都可以
如果你之前没有跳过cudnn，则需要将
#USE_CUDNN := 1的#去掉
如果你opencv版本是3你需要把opencv_version:=3的#也去掉
其他配置自行查看，根据之前的步骤只需要把cudnn那一行注释去掉即可
然后
将# Whatever else you find you need goes here.下面的
INCLUDE_Dirs := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include
LIBRARY_Dirs := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib
修改为：
INCLUDE_Dirs := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial
LIBRARY_Dirs := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial
然后
(5)修改makefile文件
打开makefile文件，做如下修改：
将：
NVCCFLAGS +=-ccbin=$(CXX) -Xcompiler-fPIC $(COMMON_FLAGS)
替换为：
NVCCFLAGS += -D_FORCE_INLInes -ccbin=$(CXX) -Xcompiler -fPIC $(COMMON_FLAGS)
(6)编辑/usr/local/cuda/include/host_config.h
将其中的第115行注释掉：
将
#error-- unsupported GNU version! gcc versions later than 4.9 are not supported!
改为
//#error-- unsupported GNU version! gcc versions later than 4.9 are not supported!
最后 sudo make all
我遇到的问题：
"libcudart.so.8.0 cannot open shared object file: No such file or directory"
解决办法是将一些文件复制到/usr/local/lib文件夹下：
#注意自己CUDA的版本号!
sudo cp /usr/local/cuda-8.0/lib64/libcudart.so.8.0 /usr/local/lib/libcudart.so.8.0 && sudo ldconfig
sudo cp /usr/local/cuda-8.0/lib64/libcublas.so.8.0 /usr/local/lib/libcublas.so.8.0 && sudo ldconfig
sudo cp /usr/local/cuda-8.0/lib64/libcurand.so.8.0 /usr/local/lib/libcurand.so.8.0 && sudo ldconfig
完成之后测试：
sudo make runtest
运行完之后如果最后左下角显示绿色的passed，则caffe配置成功，大功告成！
VI. 小试牛刀
到这里caffe已经配置完毕，我们来找一组dataset测试一下，这里选用cifar-10.
具体流程caffe官网有http://caffe.berkeleyvision.org/gathered/examples/cifar10.html
我简单写一下
首先下载安装cifar-10,这里我assume你安装caffe的文件夹就叫caffe
cd caffe
./data/cifar10/get_cifar10.sh
./examles/cifar10/create_cifar10.sh
然后就好了，简单吧，来一组快速测试：
cd caffe
./examples/cifar10/train_quick.sh
泡杯茶的功夫他应该已经跑完了，设置的iteration只有5000，最后会显示Optimization done.
VII. 总结
不多说了，坑巨多，具体有问题请留言我尽量帮忙
reference:
http://www.2cto.com/kf/201610/552429.html
http://askubuntu.com/questions/767269/how-can-i-install-cudnn-on-ubuntu-16-04