Windows – Java应用程序在JRE更新后阻止服务器重新启动

如果我有一个已启动的Java应用程序并启动系统重启 – Windows无法自动停止此Java应用程序,我收到以下消息：
“此程序阻止Windows重新启动”.
如果我按下取消,那么我可以看到阻止重新启动的Java应用程序挂起.
此问题会影响我的Java应用程序和jconsole等应用程序.

在JRE更新之前,JRE 1.6.0_26上的一切正常.
我首先在JRE 1.6.0_36上遇到了这个问题.但它也发生在1.6.0_39.

P.S：我有Windows Server 2008 R2 Interprise

有没有人有同样的问题或者可以建议在这种情况下做什么？
谢谢.

更新：
我已经实现了以下addhook：

Runtime.getRuntime().addShutdownHook(new Thread() {
public void run() {
logger.log("SHUTDOWN - BEGIN");
((Window) view).setVisible(false);
logger.log("SHUTDOWN - Visible");
((Window) view).dispose();
logger.log("SHUTDOWN - dispose");
System.exit(0);
}
});

在具有这样的addhook的应用程序通常在系统重启时关闭之后,但我发现如果我们只关闭应用程序(通过按exit或“x”)Java VM未终止(我们可以在taskmgr中看到javaw进程).

从日志文件中我可以看到该程序永远不会离开dispose()函数.如果我评论dispose()并且只留下System.exit(0)Java VM仍然无法终止.

更新2：
已为此问题创建了故障单.我们收到了Oracle的回复：“问题被复制并确认.”